海上探査とは、センサーを乗せた木枠を海底より出来る限り1.0ｍ以内に保持しながら探査を行う方法です。​

探査船の船位位置の確認方法は、予め航行ライン定めてそのライン上をGNSS測位システムを用いてリアルタイムで位置情報を取得しながら航行します。
木枠を海底1.0ｍ以内に保持しながら航行するために、音響測深機にて海底と木枠の位置を測深し、電動ウインチを上下させながら調整します。

探査位置と測定記録との整合性を図るため、測量員が船位測定データ上でカット（開始時、終了時、測線上30ｍ毎など）した瞬間に合図をし、磁気測定記録及び音響測深記録に　マークを入れ、探査船の位置との関連づけをします。